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·常規(guī)信息  最近更新:2024年6月12日 11:26:00
基因(座)名稱細胞壁轉(zhuǎn)化酶; 籽粒充實度基因; 籽粒灌漿基因
GRAIN INCOMPLETE FILLING 1; cell wall invertase gene; white belly 1
基因符號GIF1; OsCIN2; WB1
所在染色體4 (已克。

GIF1(GU797900-GU798049, Wang et al. 2010), OsCIN2(AY340072, Wang et al. 2008), WB1(Os04t0413500, Wang et al. 2018), 位于同一基因位點...

GIF1,在水稻籽粒發(fā)育時,控制著蔗糖運輸卸載和灌漿。普通栽培稻的等位基因灌漿好、籽粒飽滿。

【突變體表型】

Wang等從中花11的突變體中篩選到一株灌漿有缺陷的突變體gif1(grain incomplete filling 1),突變體在形態(tài)和結實率上表現(xiàn)正常,但灌漿程度比野生型低、籽粒淀粉粒排列松散、堊白度高,最終的粒重比野生型低24%、直鏈淀粉和支鏈淀粉含量也明顯比野生型低(Wang et al., 2008)。

【生物學功能】

WB1調(diào)控水稻胚乳發(fā)育。相比野生型,wb1穎殼棕色,每穗穎花數(shù)、每穗實粒數(shù)、結實率顯著下降,堊白率和堊白度分別94.8%和47.6%,種子的長、寬、厚都顯著下降,千粒重下降約34%,直鏈淀粉和支鏈淀粉含量顯著降低,膠稠稠度、糙米率、精米率和整精米率顯著下降。wb1胚乳中淀粉顆粒球形松散堆積,與野生型密集不規(guī)則多面體淀粉顆粒形成對比(Wang et al. 2018)。

GIF蛋白控制稻米組織包括谷物中的淀粉數(shù)量。現(xiàn)代栽培稻的GIF1 因有嚴格的組織表達特異性,有利于籽粒灌漿,提高水稻產(chǎn)量;野生稻的基因表達部位則不同,不利于灌漿而低產(chǎn)。

GIF1 因負責控制蔗糖酶(轉(zhuǎn)化酶)的活性,蔗糖酶位于細胞壁上,它把蔗糖轉(zhuǎn)化成用于制造淀粉的物質(zhì)。蔗糖酶對于水稻谷粒發(fā)育過程中的淀粉形成很重要。如果蔗糖酶不活躍,水稻植株可能就無法制造飽滿可食用的谷粒。

【定位與克隆】

GIF1基因初步定位于水稻第4染色體,后精確至32 kb大小的區(qū)間。RT-PCR分析和功能互補實驗表明,Os04g33740基因即GIF基因,cDNA全長2089bp,包含7個外顯子,編碼598個氨基酸組成的蛋白產(chǎn)物,而gif1 突變體的等位基因則發(fā)生一個堿基的缺失。分析表明,GIF蛋白是一種細胞壁轉(zhuǎn)化酵素,序列上與玉米的Mn1 和西紅柿的LIN5 高度相似(Wang et al. 2008)。

【評論】

增加每一粒稻米的重量――名為籽粒灌漿――曾經(jīng)并且依然是人們選擇水稻的目標。之前的研究為一些基因分離出了QTL,然而Wang等人則報告了這一整個過程的一種關鍵調(diào)節(jié)物,一種細胞壁轉(zhuǎn)化酵素,能夠控制稻米組織,包括谷物中的淀粉數(shù)量。他們發(fā)現(xiàn),GRAIN INCOMPLETE FILLING 1(GIF1)利用一種突變篩子,同時將GIF1植入轉(zhuǎn)基因水稻,從而確認其功能。Wang等人還對這種基因的歷史進行了研究,進而證明它的啟動區(qū)在馴養(yǎng)水稻的過程中經(jīng)歷了一次選擇清掃,這就像人們預期的那樣。更進一步的研究如今將聚焦這一領域,以便更多地利用這一基因。

【相關登錄號】
contigs及其產(chǎn)物:AP014960BAS89136
基因及產(chǎn)物ID號:GU797909ADE60571, GU797938ADE60600
cDNAs及其產(chǎn)物:AY340072AAQ24868, AK072276BAG92903, AY578159AAT84402, EU095553ABW80997
NCBI GenBank ESTs:CI222605, CI768497
參考基因組位點:Os04g0413500(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務←→ LOC_Os04g33740(本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務←→ LOC4335790(NCBI)
參考基因組產(chǎn)物:XM_015778048XP_015633534
uniprot庫登錄號:Q0JDC5, B5KNJ4
·ONTOLOGY及相關基因
表型特征粘性胚乳(TO:0000098), 谷物產(chǎn)量(TO:0000396), 胚乳顏色(TO:0000487), 直鏈淀粉含量(TO:0000196), 支鏈淀粉含量(TO:0000097), 每穗實粒數(shù)(TO:0000447), 結實率(TO:0000448), 粒寬(TO:0000975), 粒長(TO:0000734), 粒厚(TO:0000399), 轉(zhuǎn)化酶活性(TO:0000311), 淀粉粒形狀(TO:0002656), 堊白胚乳(TO:0000266), 種子成熟度(TO:0002661), 千粒脫殼谷粒重(TO:0000592), 穎片顏色(TO:0000221), 葡萄糖含量(TO:0000300), 單株產(chǎn)量(TO:0000449), 每穗穎花數(shù)(TO:0000456), 種子長度(TO:0000146), 種子寬度(TO:0000149), 種子厚度(TO:0000304)
分子功能蔗糖α-葡萄糖苷酶活性(GO:0004575)
生物進程淀粉生物合成(GO:0019252), 胚乳發(fā)育調(diào)控(GO:2000014)
形態(tài)構造灌漿結實期(GRO:0007141), 果實(PO:0009001)
·參考文獻
1Hong Wang;Yingxin Zhang;Lianping Sun;Peng Xu;Ranran Tu;Shuai Meng;Weixun Wu;Galal Bakr Anis;Kashif Hussain;Aamiar Riaz;Daibo Chen;Liyong Cao;Shihua Cheng;Xihong Shen
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