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·常規(guī)信息  最近更新:2023年11月7日 5:09:00
基因(座)名稱多聚嘧啶區(qū)結(jié)合蛋白
polypyrimidine tract-binding protein
基因符號OsPTB1
所在染色體1 (已克。

OsPTB1(Os01g64770, Chen et al. 2022)...

【突變體表型】

 

【定位與克隆】

 

【時(shí)空表達(dá)譜】

OsPTB1OsPTB2均在幼穗中高表達(dá) (Chen et al. 2022)。

【亞細(xì)胞定位】

 

【生物學(xué)功能】

OsPTB1/2通過與FZP mRNA 3' UTR的富含CU元件(CUREs)互作,抑制FZP的翻譯,調(diào)控穗發(fā)育。與野生型相比,敲除突變體osptb1/2FZP翻譯效率提高,矮稈,小穗,二次枝梗數(shù)降低27.0%,每穗粒數(shù)(GNP)降低29.6%,一次枝梗數(shù)無顯著差異。而過表達(dá)OsPTB1/2降低了體內(nèi)外融合FZP 3'UTR的報(bào)告基因的翻譯(Chen et al. 2022)。

【相關(guān)登錄號】
contigs及其產(chǎn)物:AP003286BAD81991; AP014957BAS75400, BAS75401, BAS75402
cDNAs及其產(chǎn)物:AK069062BAG91238, AK062260, AK066622
參考基因組位點(diǎn):Os01g0867800(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)←→ LOC_Os01g64770(本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)←→ LOC4325048(NCBI)
參考基因組產(chǎn)物:XM_015758112XP_015613598, XM_015758123XP_015613609, XM_015758119XP_015613605, XM_015758117XP_015613603
uniprot庫登錄號:A0A0P0VAZ5, B8A6Y2, Q0JHE8
·ONTOLOGY及相關(guān)基因
表型特征株高(TO:0000207), 每穗粒數(shù)(TO:0002759), 二次枝梗數(shù)(TO:0000557), 單穗產(chǎn)量(TO:0000450)
分子功能翻譯調(diào)控因子活性(GO:0045182), mRNA結(jié)合(GO:0003729)
生物進(jìn)程穗發(fā)育(GO:0010229), 節(jié)間發(fā)育模式建成(GO:0080006), 翻譯調(diào)控(GO:0006417)
·參考文獻(xiàn)
1Qiong Chen;Fa'an Tian;Tingting Cheng;Jun'e Jiang;Guanlin Zhu;Zhenyu Gao;Haiyan Lin;Jiang Hu;Qian Qian;Xiaohua Fang;Fan Chen
  Translational repression of FZP mediated by CU-rich element/OsPTB interactions modulates panicle development in rice
  The Plant Journal, 2022, 110(5): 1319-1331
中國水稻研究所
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