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·常規(guī)信息  最近更新:2023年11月7日 5:14:00
基因(座)名稱多聚嘧啶區(qū)結合蛋白
polypyrimidine tract-binding protein
基因符號OsPTB2
所在染色體5 (已克隆)

OsPTB2(Os05g36120, Chen et al. 2022)...

【突變體表型】

 

【定位與克隆】

 

【時空表達譜】

OsPTB1OsPTB2均在幼穗中高表達 (Chen et al. 2022)。

【亞細胞定位】

 

【生物學功能】

OsPTB1/2通過與FZP mRNA 3' UTR的富含CU元件(CUREs)互作,抑制FZP的翻譯,調(diào)控穗發(fā)育。與野生型相比,敲除突變體osptb1/2FZP翻譯效率提高,矮稈,小穗,二次枝梗數(shù)降低27.0%,每穗粒數(shù)(GNP)降低29.6%,一次枝梗數(shù)無顯著差異。而過表達OsPTB1/2降低了體內(nèi)外融合FZP 3'UTR的報告基因的翻譯(Chen et al. 2022)。

【相關登錄號】
contigs及其產(chǎn)物:AP014961BAS94212
cDNAs及其產(chǎn)物:AK102760BAG95704
參考基因組位點:Os05g0437300(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務←→ LOC_Os05g36120(本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務←→ LOC4338905(NCBI)
參考基因組產(chǎn)物:XM_015783907XP_015639393, XM_015783905XP_015639391, XM_015783906XP_015639392
uniprot庫登錄號:A0A0P0WMZ9, A0A8J8YT17, B8AYK8, B9FPS8, Q0DHV7, Q5TKN2
·ONTOLOGY及相關基因
表型特征株高(TO:0000207), 每穗粒數(shù)(TO:0002759), 二次枝梗數(shù)(TO:0000557), 單穗產(chǎn)量(TO:0000450)
分子功能翻譯調(diào)控因子活性(GO:0045182), mRNA結合(GO:0003729)
生物進程穗發(fā)育(GO:0010229), 節(jié)間發(fā)育模式建成(GO:0080006), 翻譯調(diào)控(GO:0006417)
·參考文獻
1Qiong Chen;Fa'an Tian;Tingting Cheng;Jun'e Jiang;Guanlin Zhu;Zhenyu Gao;Haiyan Lin;Jiang Hu;Qian Qian;Xiaohua Fang;Fan Chen
  Translational repression of FZP mediated by CU-rich element/OsPTB interactions modulates panicle development in rice
  The Plant Journal, 2022, 110(5): 1319-1331
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